胎兒樣本采集
目前，在不終止妊娠的情況下，兩種檢材可以用作胎兒親子鑒定—胎兒羊水和胎兒絨毛組織。一般在懷孕2-4月可以采取胎兒絨毛進行親子鑒定；在懷孕4月-出生前（月份越大，不建議采集羊水），可以抽取胎兒羊水進行親子鑒定。也就是說懷孕65天以后，都可以采取以上兩種方法的一種對胎兒進行親子鑒定。
胎兒樣本提取方法：
提取絨毛
是在B超的可視監控下，利用可控負壓細管經陰道-子宮頸到達胚胎絨毛膜表面采集絨毛。
胎兒親子鑒定一般在孕婦懷孕55天-70天時抽取絨毛做鑒定，抽取絨毛相對比較安全，但是有千分之三的流產率，絨毛抽取不會對胎兒出生以后造成影響。
羊水穿刺
孕婦在懷孕16周以后可以抽取羊水進行胎兒親子鑒定，這個階段胎兒相對比較穩定，風險相對比較低。只需抽取2-3毫升羊水即可；
羊水穿刺術用于產前診斷至今已有30年的歷史，無論診斷的準確性及安全性都得到了醫學界的公認。羊水穿刺的難度因人而異，主要與胎盤的位置、胎兒體位、穿刺部位的羊水量、胎兒活動等有關。由于目前穿刺均在B超的可視監控的引導下完成，損傷到胎兒的可能微乎其微。
胎兒羊水親子鑒定的優點是手術風險小，并發癥少。缺點是明確胎兒的生物學父親較晚，如果將胎兒引產對孕婦損傷較大。
胎兒絨毛親子鑒定的優點是可以讓孕婦在懷孕早期明確胎兒的生物學父親，及時采取措施，決定保住胎兒或者將胎兒在3月前流產（孕婦損傷小）。缺點是絨毛采集的手術風險比較大，容易導致流產。
