測定血痕的DNA多態性，可作個人識別。親子鑒定血痕的DNA分析方法與血液相同，但提取DNA時要盡量除去的雜質和過量的血紅蛋白和正鐵血紅素等，以免其抑制DNA限切酶消化及PCR反應。可以作熱浸漬PCR或用Chelex處理血痕檢材或在PCR反應液中加入小牛血清白蛋白等，可消除血紅蛋白衍生物、染色體料等影響。現已應用作血痕個人識別的DNA分析的DNA分析有HLA-DAa,PM,mtDNA,多種VNTR，如D1S80、ApoB、D17S30，多種STR，以及ABO，MN等位基因型。
DNA分析還可作血痕的種屬鑒別，性別鑒定以及親子鑒定。
